库拉托拉博士表示，口腔中含有数十亿口腔微生物，当它们处于健康状态时，就可以抗击一些致命病毒和细菌的入侵。然而，使用含洗涤剂成分的牙膏或含酒精的漱口水，会破坏口腔微生物平衡。
因此，不能依靠某些抗菌牙膏来除去口腔及牙刷上的细菌。库拉托拉博士建议，清洁牙刷时应该用温肥皂水洗涤牙刷，再用干净的纱布擦净牙刷，然后放在通风处晾干，以避免滋生细菌，并保证每年至少更换4把牙刷。切不可用微波炉给牙刷消毒，因为牙刷大部分由塑料制成，微波加热会使塑料变形、刷毛分解，并产生双酚A，有可能导致不孕及多种癌症。
牙刷放错位置也会利于病菌滋生。库拉托拉博士表示，大多数人将牙刷放在浴室内，这样很容易受到粪便细菌等微生物污染。他建议，最好将牙刷放在距离马桶2米以外的地方。此外，将牙刷放入密不透气的塑料盒，也有利于病毒和细菌的繁殖。美国疾控中心建议，不要把牙刷放入塑料盒内，应将刷毛朝上摆放在通风处。
上文介绍了比较科学的牙刷清洁方式，小小的一个牙刷就有可能造成残留无数真菌的可能。因此做到正确清洁牙刷就可能减少一些有害细菌的滋生。
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